發(fā)布時間: 2024-08-07 10:06:39
1.數(shù)據(jù)庫概述
1.1背景信息
SEER數(shù)據(jù)庫(Surveillance, Epidemiology, and End Results,監(jiān)測、流行病學(xué)和最終結(jié)果)是由美國國立癌癥研究所(NCI)創(chuàng)建并維護(hù)的一個大型公共數(shù)據(jù)庫,數(shù)據(jù)獲取方便并且公開免費(fèi),深受廣大腫瘤領(lǐng)域科研工作者的喜愛。該數(shù)據(jù)庫記錄了美國部分州縣上百萬名惡性腫瘤患者的發(fā)病率、死亡率和患病情況等信息,主要提供了臨床資料,如性別、年齡、種族、地理位置、婚姻狀態(tài)、腫瘤大小、腫瘤病理、腫瘤偏側(cè)、腫瘤WHO分級、TNM 分期、腫瘤部位等,為缺少臨床科研數(shù)據(jù)的臨床研究者提供了很好的數(shù)據(jù)來源。自1973年創(chuàng)建以來,SEER數(shù)據(jù)庫已經(jīng)成為全球最全面的癌癥數(shù)據(jù)資源之一。
1.2數(shù)據(jù)庫用途
SEER數(shù)據(jù)庫樣本量大,統(tǒng)計(jì)學(xué)效能強(qiáng),這使基于SEER數(shù)據(jù)庫的研究具有較高的臨床參考價(jià)值,被廣泛用于癌癥研究、公共衛(wèi)生規(guī)劃、政策制定和教育。
1.3數(shù)據(jù)采集方式
SEER數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)通過一系列嚴(yán)格的收集和報(bào)告程序獲得,涉及多個癌癥登記處。數(shù)據(jù)來源包括醫(yī)院、門診診所、病理實(shí)驗(yàn)室和其他醫(yī)療機(jī)構(gòu)。調(diào)查詳情可以在SEER官方網(wǎng)站的方法與工具欄目進(jìn)行查看。
1.4樣本特征
SEER計(jì)劃始于1973年1月1日。在過去的50年里,地理面積和人口覆蓋率都有所擴(kuò)大,占當(dāng)今美國人口的近50%。SEER數(shù)據(jù)庫的樣本涵蓋了不同年齡、性別、種族和社會經(jīng)濟(jì)背景的人群,特別關(guān)注少數(shù)族裔和其他弱勢群體,以確保數(shù)據(jù)的代表性和全面性。SEER人口與美國總?cè)丝谔卣鞅容^,SEER人口中外國出生人口的比例往往高于美國普通人口。
2.使用方式
2.1
訪問與獲取
數(shù)據(jù)庫在每年11月對提交數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控檢測,并在來年4月開放,更新會在官網(wǎng)顯示,若需要重新申請權(quán)限會以郵件提示。SEER數(shù)據(jù)庫提供了一個在線查詢系統(tǒng)SEERStat,研究人員可以通過這個工具訪問和分析數(shù)據(jù)。用戶需要先下載并安裝SEERStat軟件,然后申請?jiān)L問權(quán)限,通過這個平臺可以自定義查詢條件,提取相關(guān)的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。通過郵箱進(jìn)行注冊登錄,進(jìn)行相關(guān)操作。
2.2
數(shù)據(jù)使用指南
3.數(shù)據(jù)類型
3.1
數(shù)據(jù)信息
包括患者的注冊編號、個人信息、原發(fā)病灶部位、腫瘤尺寸、腫瘤編碼、治療方案、死亡原因等。
3.2
數(shù)據(jù)范圍
9大類腫瘤:乳腺、結(jié)腸&直腸、其他消化系統(tǒng)、女性生殖、淋巴&白血病、男性生殖、呼吸系統(tǒng)、泌尿系統(tǒng)及其它尚未確指的類型。
4.研究案例
#4.1研究案例(一)
2023年10月16日中國醫(yī)科大學(xué)附屬第四醫(yī)院普外科學(xué)者在《PLoS One》(二區(qū)top, IF=2.9)發(fā)表題為:“Competing-risks model for predicting the prognostic value of lymph nodes in medullary thyroid carcinoma”的研究論文。文章基于SEER數(shù)據(jù)庫1998 - 2016年診斷為MTC的患者資料,建立Cox比例風(fēng)險(xiǎn)和競爭風(fēng)險(xiǎn)模型,回顧性分析相關(guān)因素對淋巴結(jié)的影響。結(jié)果表明,在排除競爭風(fēng)險(xiǎn)后,淋巴結(jié)數(shù)量、陽性數(shù)量和陽性比例是甲狀腺髓樣癌預(yù)后不良的因素。
#4.2研究案例(二)
2023年10月12日新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院婦科,中亞高發(fā)疾病發(fā)病機(jī)制與防治國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室學(xué)者在《BMJ Open》(二區(qū)top, IF=2.4)發(fā)表題為:“Establishment of prediction models to predict survival among patients with cervical cancer based on socioeconomic factors: a retrospective cohort study based on the SEER Database”的研究論文。文章基于SEER數(shù)據(jù)庫2007年至2011年間診斷為宮頸癌的5954例患者的數(shù)據(jù)。采用單因素和多因素Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型估計(jì)和分析社會經(jīng)濟(jì)因素與宮頸癌患者總生存期(OS)的相關(guān)性,構(gòu)建和驗(yàn)證基于社會經(jīng)濟(jì)因素預(yù)測宮頸癌(OS)的預(yù)測模型。結(jié)果表明,與單獨(dú)的AJCC分期系統(tǒng)相比,基于社會經(jīng)濟(jì)因素和AJCC分期系統(tǒng)的預(yù)測模型在預(yù)測宮頸癌OS方面具有較好的效果。
#4.3研究案例(三)
美國馬薩諸塞州波士頓塔夫茨大學(xué)醫(yī)學(xué)院圣伊麗莎白醫(yī)學(xué)中心醫(yī)學(xué)系學(xué)者在《Breast Cancer Res Treat》(二區(qū)top, IF=3.0)發(fā)表題為:“Survival analysis of patients with brain metastases at initial breast cancer diagnosis over the last decade”的研究論文。文章基于SEER數(shù)據(jù)庫2010至2019年IV期乳腺癌患者信息,采用多變量邏輯回歸分析初次乳腺癌診斷時腦轉(zhuǎn)移的預(yù)測因素,使用Kaplan-Meier方法估計(jì)OS,并使用log rank檢驗(yàn)比較組間差異,利用Cox回歸評估幾個變量與OS之間的關(guān)聯(lián)。結(jié)果表明,在過去十年中,腦轉(zhuǎn)移患者在初次診斷乳腺癌時的中位OS仍然很差。除腫瘤亞型外,OS還根據(jù)年齡、顱外轉(zhuǎn)移和社會人口學(xué)因素而變化。
END
上一篇:40% 的 GDM 媽媽們都有這種困擾,你中招了嗎?
下一篇:左手宏基因組學(xué),右手代謝組學(xué),左右開弓以揭示胃食管反流病兒童的腸道菌群與血清代謝物的關(guān)聯(lián)